La historia gira en torno a las vidas de varias personas que deben unirse para sobrevivir a un tornado catastrófico que amenaza con destruir su ciudad.
Como sugiere el título de la película, el tornado golpea en apenas 13 minutos, lo que deja a los residentes con muy poco tiempo para reaccionar y prepararse. La película presenta una serie de personajes interconectados, cada uno de los cuales enfrenta sus propias luchas personales mientras intenta proteger a sus familias y seres queridos.
Desde una mujer joven (interpretada por Thora Birch) que intenta reconciliarse con su madre distanciada (Amy Smart) hasta un hombre (Trace Adkins) que busca redimirse por los errores del pasado, los viajes de los personajes se desarrollan en el intenso contexto del desastre inminente.